394569dd5355c5ac78e2fbe19451b88f_在线真题试卷与模拟练习_394569dd5355c5ac78e2fbe19451b88f_考试宝

更新时间：试题数量：购买人数：提供作者：

有效期：个月

章节介绍：共有个章节

收藏

我的练习

我的错题
(0道)

我的收藏
(0道)

我的斩题
(0道)

我的笔记
(0道)

专项练习

顺序练习 0 / 0

随机练习 自定义设置练习量

题型乱序 按导入顺序练习

模拟考试 仿真模拟

题型练习 按题型分类练习

易错题 精选高频易错题

学习资料 考试学习相关信息

搜索

题库预览

请举例说明某一算法的敏感性和特异性？某一算法的优劣可以通过一定的标准，如敏感性( sensitive)和特异性(specifity)来衡量。假设待测序列中有M条序列是基因序列，而剩余的为非基因序列。我们用某一程序（算法）对该序列进行预测，共预测出N条基因序列，而这N条序列中有N1条确实为基因（即预测准确），则敏感性定义为N1/M，它表示程序预测的能力大小，特异性定义为N1/N，它表示程序预测结果的可靠程度。敏感性和特异性往往是一对矛盾。

系统发生树的实际构建中怎么选用距离矩阵法、最大简约法和最大似然法？ ①距离矩阵法：是根据每对物种之间的距离，其计算一般很直接，所生成的树的质量取决于距离尺度的质量，距离通常取决于遗传模型。 ②最大简约法：较少涉及遗传假设，它通过寻求物种间最小的变更数来完成。由于该方法基于数据测算所有树形的可能性，所以计算量很大，一般超过12个OU就难以建树。 ③最大似然法：特征是对模型的巨大依赖性，该方法在计算上繁杂，但为统计推断提供了良好基础。该方法特别适用于那些序列间差异非常明显的进化分析，同时它可以利用不同进化模型构建最佳系统发生树。（含图）

进行Blastx,Tblastn,Tblastx搜索时，把核酸序列进行6框翻译成氨基酸而不是1框翻译的理由是什么？密码子是三个核苷酸指向一个氨基酸，如果不知道起始核苷酸就只能把每个核苷酸各自当做起始核苷酸，这样就能得出三种翻译框。还有，DNA是双螺旋结构，如果不知道那一条是模板链就只能把两条链都当做模板链，这样就能出现两种模板链。每条模板链各有三种翻译框，最后就是六种翻译框，就是一条双螺旋核酸序列翻译成肽链时一切可能的情况反映。

进行PHI-blast时，大括号，中括号，小括号，X的作用是什么？ {}表示除了括号中的氨基酸 []表示在括号中任意一个氨基酸残基 X表示任意氨基酸残基(residue) (2,4)表示2到4个的氨基酸

目前全基因水平基因注释所利用的从头测序方法的主要问题是什么？ ①很多从头预测软件预测新物种基因时，是利用已有模式物种的基因进行统计参数估计。即使是非常相近的物种，它们之间的内含子长度、密码子频率、GC含量等重要参数也均会存在一定的差异。为了解决该问题，需要通过该物种的特定基因训练数据集获得统计参数。 ②足够的训练数据集可以在基因数量层次上保证准确，但内含子-外显子剪切位点的准确率仍然较低(60%~70%)。

请列举各代DNA测序技术中具有代表性的测序技术名称？第一代测序技术——Sanger法、化学降解法、第二代测序技术——Roche公司的454测序技术、Illumina公司的Solexa和Hiseq技术、ABI公司的SOLiD技术第三代测序技术——tSMS、SMRT、Nanopore

请利用动态规划Needleman-Wunsch算法对下列两条核苷酸序列进行全局联配，获得最优联配结果： S-ACGCTG T=CATGT；计分矩阵：匹配得2分，不匹配罚1分，空位罚1分。（含图）

请详细说明第一代测序技术-Sanger法。第一代DNA测序技术主要为(1977年（桑格）Sanger)等提出的双脱氧链终止法，也称为Sanger法。 Sanger法的核心原理是：双脱氧核糖核苷酸(ddNTP)的2’和3’位置都不含羟基（图1-1.1右），因此ddNTP在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键，从而中断DNA的合成反应；在个DNA合成反应体系中分别加入一定比例的带有放射性同位素标记的ddATP、ddCTP、ddGTP和ddTTP,通过凝胶电泳和放射自显影后可根据电泳条带的位置确定待测分子的DNA序列（图1-1.2）。 Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始，随机在某一个特定的碱基处终止，并且在每个碱基后面进行荧光标记，产生以A、T、C、G结束的四组不同长度的一系列核苷酸，然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测，从而获得可见DNA碱基序列的一种方法。 Sanger法测序的具体步骤如下： ①分离待测核酸模板，在4支试管中分别加人适当的引物、模板、DNA聚合酶和4种脱氧核糖核苷酸(dNTP),再在上面4支试管中分别加人一定浓度的带有放射性同位素标记的ddATP ddCTP、ddGTP和ddTTP ②进行DNA合成反应。加入的引物在DNA聚合酶作用下从5’端向3’端进行延伸反应。当ddNTP掺入时，由于它在3’位置没有羟基，故不能与下一个dNTP结合，从而使链延伸终止。由于ddNTP在不同位置掺入，所以产生一系列不同长度的新的DNA链。 ③用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳同时分离支反应管中的反应产物，由于每一反应管中只加一种ddNTP(如ddATP).则该管中各种长度的DNA都终止于该种碱基（如A)处，所以凝胶电泳中该泳道不同带的DNA的3’末端都为同一种双脱氧碱基。 ④放射自显影。根据四泳道的编号和每个泳道中DNA带的位置直接从自显影图谱上读出与模板链互补的新链序列。（含图）

对序列PAWHEAEAG和AGWGAHEA-进行联配（结合表格中的联配矩阵）【缺少答案，请补充】（含图）

请详细列举生物分子数据库。 A，核苷酸及其相关数据库： DNA/RNA序列数据库；基因组数据库；非编码RNA数据库（非编码小RNA数据库；长非编码RNA数据库；RNA家族等其他RNA数据库） B，蛋白质及其相关数据库：蛋白质序列数据库；蛋白质结构数据库；蛋白质组数据库；蛋白质功能域数据库；蛋白质分子互作数据库 C，代谢途径等专业数据库：代谢途径数据库；代谢组学数据库；表型数据库

设有4段序列，分别为A：TAGG；B：TACG;C：AAGC；D: AGCC。利用非加权平均连接聚类法（UPGMA）方法构建系统发育树。【缺少答案，请补充】（含图）

请写出二十种氨基酸及单字母代码。（教材16页）（含图）

请写出四种核苷酸代码以及兼并代码。（教材424页）（含图）

1